Gegen das Management von Tomsk Avia wurde ein Strafverfahren eingeleitet.

Der Grund für die Einleitung eines Strafverfahrens war die Nichtzahlung von Löhnen an Mitarbeiter der Fluggesellschaft. Derzeit steckt die Fluggesellschaft in sehr ernsten wirtschaftlichen Schwierigkeiten, weshalb bereits mehrere Dutzend Flugzeuge und zwei Flughäfen, die voraussichtlich zur Versteigerung kommen, von der Fluggesellschaft beschlagnahmt wurden.

Aus offiziellen Dokumenten geht hervor, dass die Gesamtverschuldung des Managements der Fluggesellschaft gegenüber den Mitarbeitern 14.5 Millionen Rubel übersteigt, und es ist möglich, dass die tatsächliche Zahl noch viel höher sein könnte.